-ทำให้มีการค้นพบไวรัสใหม่ๆ มากยิ่งขึ้น โดยการรวมเอา NGS และวิธีการ random PCR สามารถตรวจหากลุ่มของไวรัสที่อยู่ภายในตัวอย่างที่สนใจทั้งที่เป็นไวรัสที่รู้จักกันอยู่แล้ว หรือเป็นไวรัสที่ยังไม่เคยมีการค้นพบมาก่อน
-สมรรถนะของเทคโนโลยี NGS ทำให้สามารถค้นพบเครื่องหมายโมเลกุล single nucleotide polymorphism (SNP) ในจีโนมของปศุสัตว์ได้เป็นจำนวนมากเครื่องหมายโมเลกุล SNP เหล่านี้ ถูกนำไปพัฒนาเป็นสนิปชิป (SNP chip) เพื่อใช้ศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างเครื่องหมายทางพันธุกรรมกับลักษณะการให้ผลผลิต และการคัดเลือกพันธุ์ในระดับจีโนม ของสัตว์เลี้ยงในฟาร์ม ถูกนำมาวิเคราะห์จีโนมของสัตว์เลี้ยงในฟาร์มหลายชนิด อาทิเช่น แกะ ไก่ โคเป็นต้น
-ถูกประยุกต์ใช้เพื่อค้นหายีนที่ควบคุมลักษณะการให้ผลผลิตสูง (เนื้อ นม ไข่) ความต้านทานต่อโรค และสวัสดิภาพของสัตว์
-การศึกษาNGS ของจีโนมปศุสัตว์ สามารถช่วยเพิ่มความเข้าใจกลไกพื้นฐานในระดับโมเลกุลของยีนที่ควบคุมลักษณะสำคัญทางเศรษฐกิจให้ดีขึ้น นอกจากนี้การวิเคราะห์ข้อมูลทางด้านจีโนมของปศุสัตว์
-การศึกษาNGS ของพืชที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจก็มีจำนวนมาก เช่น ข้าว ข้าวโพด มันสำปะหลัง เป็นต้น องค์ความรู้ด้านพันธุศาสตร์และจีโนมิกส์ของพืชเศรษฐกิจเหล่านี้มีระดับที่แตกต่างกันการศึกษาพันธุศาสตร์ของพืชได้ในทุกระดับ เช่นการค้นหาลำดับเบสและวิเคราะห์จีโนมของorganelles ในเซลพืช ซึ่งได้แก่ plastid genome และ mitochondrial genome ไปจนถึง nuclear genome
-การศึกษาค้นหายีน ศึกษาระดับการแสดงออกของยีน และวิเคราะห์ความแปรปรวนทางพันธุกรรม ในประชากรนั้นๆ
-ได้เข้ามามีบทบาทและถูกนำมาประยุกต์ใช้กับงานบริการและการวิจัยในหลากหลายสาขา รวมทั้งการบริการทางการแพทย์และการวิจัยในมนุษย์
-การใช้ NGS เพื่อการวินิจฉัยโรคหายากและการดูแลรักษาผู้ป่วยมะเร็งแบบเฉพาะบุคคล