รายการบทความการแลกเปลี่ยนเรียนรู้ทั้งหมดของ Blog : ชีวสารสนเทศสำหรับนักจุลชีววิทยา
โครงการอบรม เรื่อง “Basic Bioinformatics for Microbiologists” ทำให้มีความรู้ความเข้าใจและได้ฝึกปฏิบัติจริงในการวิเคราะห์ แปลผล และประยุกต์ใช้ข้อมูลทางชีวสารสนเทศ (bioinformatics) ซึ่งมีความจำเป็นในงานวิจัยทางจุลชีววิทยาในปัจจุบัน โดยวิทยากรผู้บรรยายคือ Dr.Apichai Tuanyok นักวิจัยไทยที่ดำรงตำแหน่ง Assistant Professor ณ Department of Infectious Diseases & Pathology, College of Veterinary Medicine, University of Florida โดยได้บรรยาย และแนะนำในการฝึกปฏิบัติในหัวข้อต่อไปนี้
1. หลักการ และโปรแกรมพื้นฐานในการศึกษาจีโนมของแบคทีเรีย ได้แก่ Genome Viewer, BioEdit Alignment Editor
2. การเปรียบเทียบจีโนม โดยใช้ Artemis Comparison Tool (ACT)
3. จีโนมของแบคทีเรียก่อโรคที่สำคัญได้ Streptococcus suis และ Burkholderia pseudomallei
4. การใช้ Online Bioinformatic Software Tools ได้แก่ PATRIC (Pathosystem Resource Integration Center) ทั้งในส่วนของ Genome Assembly และ Genome Annotation
โดยเป้าหมายในการนำมาใช้เป็นข้อมูลในงานวิจัย คือ การใช้ เทคนิค next generation sequencing วึ่งเป้นเทคนิคที่นิยมใช้การอย่างแพร่หลายมาขึ้น เนื่องจากทำให้ได้ข้อมูลขอลำดับ nucleotides จำนวนมาก ซึ่งข้อมูลที่ได้นั้นต้องมีการวิเคราะห์ และแปลผลด้วยโปรแกรมที่เหมาะสมดังกล่าวข้างต้น ให้ได้เป็นข้อมูลทางชีวสารสนเทศ ที่สามารถนำไปใช้ให้เกิดประโยชน์ได้
URL สำหรับอ้างอิงถึงหน้านี้